骨肉瘤手术治疗首先要决定是否可施行保肢手术。一般应遵循如下原则：保肢手术应提供和截肢一样的治愈机会；短期风险和长期并发症在可以接受的范围内；肢体的功能和外观结果等同于或优于截肢；重建方法获得患儿及其父母的接受。如果“跳跃式”转移灶未被发现或存在潜在性转移灶，截肢手术并不能保证局部控制，现代保肢手术的局部复发率为5％～10％，与截肢手术相比没有显著差异且未增加患者死亡率。较多学者认为发生病理性骨折的骨肉瘤患者不宜进行保肢手术，但病理性骨折不是保肢手术的绝对禁忌证。从功能角度上讲，上肢截肢术后的功能结果很差，因此应在获得充分手术切除边缘的前提下，积极进行包括血管神经移植的保肢手术，以保留即使非常有限的手及腕关节功能。下肢以负重功能为主，接受膝上截肢的患者较假体重建患者的能量消耗大，然而，随着现代假肢技术中轻质材料和液压关节的使用，膝上截肢可以有优良的功能并能参加体育活动。目前获得一致认可的具有预测性的负性因素包括：诊断时发现转移灶、对化疗的组织学反应性差和手术前发生病理性骨折 ：尽管组织学评估是对化疗反应性评价的金标准，但因其在手术选择时不能获得结果，所以临床意义有限。此外，肿瘤原发部位和肿瘤大小也是重要的预测因素。血清乳酸脱氢酶和碱性磷酸酶也有一定的预测意义，但其更可能代表肿瘤负荷。