基因芯片技术通过对肿瘤基因表达谱分析，组成肿瘤基因诊断芯片，研究肿瘤基因的功能，既可用于肿瘤普查，又能达到早期诊断和早期治疗的目的。基因芯片要成为临床诊断和治疗肿瘤普遍采用的技术仍有一些关键问题需要解决：①现阶段芯片检测的灵敏度决定了需要首先扩增模板，而一般采用PCR方法，不可避免带来PCR所具有的局限性。②目前采用的荧光标记方法存在检测灵敏度低的问题。③ 芯片杂交的条件高度个体化，难以形成比较统一的、规范的杂交环境，会给应用带来障碍。④ 芯片成本及后期信息处理费用较高。随着生命科学技术的进一步发展，这些问题将会被逐步解决，基因芯片在肿瘤临床治疗中会显示出越来越重要的作用。