肿瘤的发生和发展是一个复杂的多阶段的生物学过程。虽然已经筛选出许多有效的抗肿瘤药物，但由于传统技术方法的局限性，肿瘤细胞对药物耐受的客观存在，很难快速找出特异性高、作用强的新化合物。随着基因芯片技术的发展，致癌基因的破译以及针对新靶点的新型抗肿瘤敏感药物不断发现，将为肿瘤治疗带来新的飞跃。

　　1 选择化疗药物，制定个性化化疗方案

　　化疗是目前临床治疗恶性肿瘤比较有效的方法之一。为了减少化疗药物的副作用，临床上应制定比较完善的个性化化疗方案。Perou利用了基因芯片检测了3个正常组织细胞和2O例]r3／T 或N 的乳腺癌患者用阿霉素化疗前后的4O例乳腺癌组织细胞的基因表达谱，并进行比较，结果发现大多数病例化疗前后的表达谱是很相近的，只有3例乳腺癌组织在进行聚类分析时与3例正常乳腺组织分为一类，临床资料表明这3例乳腺癌患者对阿霉素化疗较为敏感。该研究证明利用基因芯片研究基因表达谱可以预测患者对阿霉素化疗药物的敏感性。Huang等通过芯片对多种肿瘤组织进行基因谱分析，发现卵巢癌组织中缺乏上调结合因子(UBF)，而其在肝细胞癌中呈现明显的高表达。UBF是一种RNA聚合霉I特异性转录因子，与转录因子SL1一起构成核糖体RNA基因催化剂。UBF高表达的肝癌细胞表现出高的顺铂敏感性，而通过使用ASODNs抑制UBF表达则对顺铂敏感性下降，因此认为，UBF可能有望成为检测癌细胞对顺铂敏感性的可靠指标。此后有采用微阵列分析发现无活性x染色体特异转录子(XIST)为复发性卵巢癌表达最显著的下调基因，进一步的临床观察表明XIST的表达水平与紫杉醇(TAX)敏感性有显著相关，因此XIST可作为卵巢癌TAX化疗敏感性的潜在预测指标。Park等用14081条人类胃癌基因组成的cDNA 芯片分析了5一FU化疗敏感及化疗抵抗的胃癌细胞基因表达谱，结果发现有13条异常基因和5-FU作用于胃癌细胞的机制有关，其中11条基因对化疗敏感胃癌细胞起正调节作用，而2条基因对化疗敏感或化疗抵抗的胃癌细胞均起负调节作用。通过此研究，可以预测5-FU对胃癌细胞的敏感性，并且提供生物指标。

　　2 捕捉放疗耐受细胞基因表达变化，提高细胞辐射敏感性很多肺癌患者在放疗疗程中，出现放疗耐受现象，直接导致放疗失败。Guo等设计一种寡核苷酸微阵列来分析两种辐射敏感度不同的肺癌细胞株一NCI—H446和A549在化疗后的基因变化，结果显示，MDM2、Bcl2、PKCZ 和PIM2基因表达水平在A549细胞中上调，而在NCI—H446细胞中下调；A549细胞中DNA 修复基因如XRCC5、ER—CC5、ERCC1、RAD9A、ERCC4表达水平程度比NCFH446细胞高得多。这一系列基因表达变化的发现对试图增加放疗耐受肺癌细胞的辐射敏感性有很大的帮助。

　　3 分析相关基因，寻找新的治疗靶点

　　随着对肿瘤细胞信号转导途径研究的不断深入，人们对肿瘤细胞内部的癌基因和抗癌基因相互作用己越来越清楚，针对肿瘤的特异性分子靶点设计肿瘤治疗方案，具有治疗特异性强、效果显著、基本不损伤正常细胞的优点。Amler等通过基因芯片比较雄激素依赖CWR22和非依赖性的CWR22一R前列腺肿瘤细胞的基因表达差异情况，发现雄激素去势后CWR22细胞中编码细胞生长、代谢、转录、呼吸相关的基因表达减少，从而使细胞处于非增殖状态，而CWR22一R细胞却处于增殖状态，激活了CWR22细胞中低表达和缺乏的基因。其中诸如编码SLOOP、FKBPS1、PSA、人激肽释放酶等雄激素依赖的基因在CWR22细胞中低表达，而在CWR22一R细胞中却表达升高，因而研究者认为雄激素非依赖性前列腺肿瘤是重新激活前列腺肿瘤细胞雄激素依赖性通路所致。通过基因芯片技术可以了解与这类雄激素非依赖性前列腺肿瘤发生相关的基因，为药物治疗前列腺肿瘤提供新的靶点。Wang等利用cDNA微阵列分析结直肠肿瘤相关的功能基因，结果发现结直肠癌(CRC)中有23条高表达基因，这些基因从结直肠腺瘤到CRC不断地处于高表达状态，其中22条基因的功能已被确认，它们参与细胞粘附、信号转导、凋亡等功能调节。在CRC发生及发展中，这些基因的发现提供了非常有价值的分子生物信息，为CRC的靶向治疗提供了一个新的靶点。

　　4 检测化疗疗效指标

　　目前，化疗目的已从既往的姑息性治疗向根治性化疗迈进。通过基因芯片检测对化疗的效果作出分子水平的客观评价，对肿瘤化疗这一领域将会有质的飞跃。Kihara等用9 216条基因的表达谱芯片观察了食管癌辅助化疗的疗效。从2O例应用同一方案(顺铂+5-FU)治疗的食管癌患者的手术癌组织标本中寻找与术后生存相关的基因。发现食管癌组织中大约有52条基因与术后生存率和辅助化疗敏感性有关。根据芯片杂交的结果分析，制定了不同基因表达水平的化疗反应积分，并指出基因化疗敏感性积分与患者的预后有显著相关性。基因芯片技术在判断食管肿瘤预后、考察化疗效果等方面显示了客观、高效、准确化的优势。Wang等用cDNA微阵列在胃癌中检测出富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白(SPARC)，其在肿瘤组织中的含量远高于周围正常组织(P< 0．001)。临床观察，SPARC低表达的患者3年存活率要高于SPARC高表达的患者(P=0．047)，因此SPARC可作为胃癌治疗效果的生物指标。